Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
PKHD1P08F94 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PKHD1P08F94 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms