Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RHOP08100 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOP08100 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOP08100 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms