Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HLA-DQB1P01920 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HLA-DQB1P01920 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HLA-DQB1P01920 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HLA-DQB1P01920 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HLA-DQB1P01920 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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