Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZBED1O96006 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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