Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBL3O95164 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBL3O95164 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms