Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC3O60481 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC3O60481 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms