Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KALRNO60229 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KALRNO60229 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms