Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TLX3O43711 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TLX3O43711 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TLX3O43711 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms