Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KDM6AO15550 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KDM6AO15550 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms