Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TO15178 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TO15178 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TO15178 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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