Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SYNJ2O15056 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms