Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms