Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NPIPB9F8W1W9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NPIPB9F8W1W9 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms