Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLXND1Q9Y4D7 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms