Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RAD54L2Q9Y4B4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RAD54L2Q9Y4B4 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms