Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KLHDC2Q9Y2U9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLHDC2Q9Y2U9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms