Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNQ9UQP3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNQ9UQP3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms