Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SHOC2Q9UQ13 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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