Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAK1Q9UPV9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAK1Q9UPV9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms