Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF8Q9UPP1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms