Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF11Q9UIL8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms