Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTNNA3Q9UI47 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms