Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI46

DNAI1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAI1Q9UI46 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAI1Q9UI46 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms