Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MLH3Q9UHC1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MLH3Q9UHC1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms