Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFDP1Q9UEE9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFDP1Q9UEE9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms