Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
COPG2Q9UBF2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COPG2Q9UBF2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms