Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TFIP11Q9UBB9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TFIP11Q9UBB9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms