Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
REREQ9P2R6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
REREQ9P2R6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms