Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCDC88CQ9P219 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC88CQ9P219 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms