Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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SH3BP4Q9P0V3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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