Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHST12Q9NRB3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms