Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CENPJQ9HC77 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CENPJQ9HC77 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms