Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDGFDQ9GZP0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDGFDQ9GZP0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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