Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MTMR12Q9C0I1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
MTMR12Q9C0I1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms