Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms