Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NIFKQ9BYG3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms