Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PLVAPQ9BX97 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLVAPQ9BX97 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms