Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KATNB1Q9BVA0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KATNB1Q9BVA0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms