Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MTA3Q9BTC8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms