Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NDFIP1Q9BT67 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms