Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MYCBPQ99417 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms