Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIN3AQ96ST3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms