Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCNX1Q96RV3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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