Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CICQ96RK0 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CICQ96RK0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms