Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARAP1Q96P48 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARAP1Q96P48 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms