Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP53Q96M91 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP53Q96M91 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP53Q96M91 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP53Q96M91 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP53Q96M91 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP53Q96M91 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CFAP53Q96M91 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP53Q96M91 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms