Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC17Q96LX7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC17Q96LX7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms