Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EP400Q96L91 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EP400Q96L91 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms