Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RPUSD4Q96CM3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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