Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NKD2Q969F2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms